Baltymų-nukleorūgščių sąveikos tyrimų skyrius
Skyriaus vedėjas:
Tel. +370-5-2234354 | Mokslo darbuotojai(-os): Dr. Giedrius Gasiūnas Dr. Saulius Gražulis Dr. Tautvydas Karvelis Dr. Elena Manakova Dr. Andrius Merkys Dr. Giedrius Sasnauskas Dr. Arūnas Šilanskas Dr. Tomas Šinkūnas Dr. Giedrė Tamulaitienė Dr. Gintautas Tamulaitis Dr. Paulius Toliušis Dr. Mindaugas Zaremba Dr. Evelina Zagorskaitė Dr. Marijonas Tutkus Dr. Nina Urbelienė Dr. Danielis Rutkauskas Dr. Marija Jankunec Dalia Smalakytė, MSc Inga Songailienė, MSc Gediminas Drabavičius, MSc Rimantė Žedaveinytė, MsC Lina Aitmanaitė, MSc Rūta Zinkevičiūtė, MSc Doktorantai(-ės): Greta Bigelytė, MSc Gediminas Drabavičius, MSc Edvardas Golovinas, MSc Irmantas Mogila, MSc Antanas Vaitkus, MSc Dalia Smalakytė, MSc Donata Dakinevičien,ė MSc Algirdas Grybauskas, MSc Gediminas Drabavičiu,s MSc Jonas Juozapaitis, MSc Studentai(-ės): Simonas Ašmontas Konstantyj Keda Danas Klimavičius Aurimas Kopūstas Eglė Kupčinskaitė Danguolė Norkūnaitė Džiugas Sabonis Rugilė Ivanickaitė Ugnė Gaižauskaitė Tomas Venclovas Gytis Druteika Aistė Petrauskaitė Karolis Sabutis Justė Paksaitė Ugnė Tylenytė Marija Duchovskytė Laborantai(-ės): Ana Tunevič Jadvyga Matulevič Ilinykh | |
Bendra tyrimų apžvalga |
Visos gyvybės formos nuo bakterijų iki žinduolių yra potencialūs virusų taikiniai. Bakterijų virusai (bakteriofagai) gali sunaikinti ištisas bakterijų populiacijas. Evoliucijos eigoje bakterijos sugebėjo išlikti sukurdamos gynybos sistemas, kurios saugo ląsteles nuo bakteriofagų ir svetimų nukleorūgščių patekimo. Kadangi bakteriofagai gali daugintis tik ląstelėje, jie kinta, ieškodami būdų kaip įveikti ląstelių gynybos barjerus, o bakterijos priverstos kurti naujas apsaugos sistemas.
Daug žmogui naudingų produktų, pvz., pieno produktai, bioaktyvūs junginiai ir vaistai, yra gaminami panaudojant bakterijas. Tokioje gamyboje bakteriofagų infekcijos yra labai pavojingos, kadangi jos gali sunaikinti visą bakterijų populiaciją, todėl pramonėje yra reikalingi bakterijų kamienai, turintys efektyvias antivirusinės apsaugos sistemas. Norint sukurti tokius bakterijų kamienus laboratorijoje, reikia suprasti, kaip veikia antivirusinės apsaugos sistemos.
Mūsų skyrius tiria fermentus ir jų kompleksus, kurie yra atsakingi už bakterijų apsaugą nuo svetimų nukleorūgščių. Labiausiai mus domina restrikcijos endonukleazių bei CRISPR molekulinio aparato struktūra ir veikimo mechanizmas. Tyrimams naudojame rentgenostruktūrinę analizę, mutagenezę, biocheminius ir biofizikinius tyrimo metodus.
Projektai
CRISPR
Restrikcijos endonukleazės
COD